El equipo humano del Colegio Mayor Pío XII lo conforman un amplio grupo de profesionales que van desde el director del centro, Pedro Sáinz de Baranda; la subdirectora, Juana González; el coordinador de régimen interno y el decano, hasta todos los profesionales de la Fundación Pablo VI que prestan servicio en el departamento de comunicación, administración e infraestructuras; los servicios de limpieza, cocina y conserjería y todos los que dan soporte informático y técnico a la actividad diaria.